Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A4Q9H015 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A4Q9H015 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms