Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM8Q9BZR9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM8Q9BZR9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM8Q9BZR9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms