Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC3Q9BY71 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC3Q9BY71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC3Q9BY71 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC3Q9BY71 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms