Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPL3Q9BY60 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL3Q9BY60 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms