Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM62Q9BVG3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM62Q9BVG3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM62Q9BVG3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms