Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB2BQ9BVA1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBB2BQ9BVA1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBB2BQ9BVA1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms