Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDUFAF3Q9BU61 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFAF3Q9BU61 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms