Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC1Q9BTX1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC1Q9BTX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms