Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC39A3Q9BRY0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A3Q9BRY0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A3Q9BRY0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A3Q9BRY0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms