Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RIOK1Q9BRS2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIOK1Q9BRS2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RIOK1Q9BRS2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIOK1Q9BRS2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms