Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RETNLBQ9BQ08 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RETNLBQ9BQ08 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms