Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms