Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VGLL1Q99990 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VGLL1Q99990 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VGLL1Q99990 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VGLL1Q99990 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VGLL1Q99990 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VGLL1Q99990 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VGLL1Q99990 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VGLL1Q99990 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms