Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDHCQ99643 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDHCQ99643 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDHCQ99643 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDHCQ99643 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHCQ99643 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHCQ99643 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHCQ99643 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDHCQ99643 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDHCQ99643 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHCQ99643 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDHCQ99643 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDHCQ99643 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDHCQ99643 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SDHCQ99643 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDHCQ99643 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHCQ99643 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHCQ99643 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHCQ99643 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHCQ99643 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHCQ99643 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDHCQ99643 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDHCQ99643 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SDHCQ99643 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDHCQ99643 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SDHCQ99643 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDHCQ99643 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDHCQ99643 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDHCQ99643 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHCQ99643 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDHCQ99643 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms