Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA3Q99618 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA3Q99618 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDCA3Q99618 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms