Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POP1Q99575 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POP1Q99575 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POP1Q99575 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POP1Q99575 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POP1Q99575 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POP1Q99575 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POP1Q99575 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POP1Q99575 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POP1Q99575 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POP1Q99575 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POP1Q99575 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POP1Q99575 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POP1Q99575 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POP1Q99575 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POP1Q99575 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POP1Q99575 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POP1Q99575 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POP1Q99575 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POP1Q99575 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POP1Q99575 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POP1Q99575 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POP1Q99575 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POP1Q99575 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POP1Q99575 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POP1Q99575 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POP1Q99575 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POP1Q99575 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POP1Q99575 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POP1Q99575 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POP1Q99575 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POP1Q99575 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POP1Q99575 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POP1Q99575 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POP1Q99575 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POP1Q99575 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POP1Q99575 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POP1Q99575 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POP1Q99575 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POP1Q99575 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
POP1Q99575 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POP1Q99575 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POP1Q99575 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POP1Q99575 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POP1Q99575 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POP1Q99575 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POP1Q99575 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POP1Q99575 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POP1Q99575 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POP1Q99575 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POP1Q99575 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POP1Q99575 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POP1Q99575 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POP1Q99575 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POP1Q99575 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POP1Q99575 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POP1Q99575 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POP1Q99575 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POP1Q99575 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POP1Q99575 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POP1Q99575 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POP1Q99575 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POP1Q99575 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POP1Q99575 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POP1Q99575 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POP1Q99575 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POP1Q99575 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POP1Q99575 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POP1Q99575 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POP1Q99575 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POP1Q99575 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POP1Q99575 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POP1Q99575 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POP1Q99575 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POP1Q99575 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POP1Q99575 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POP1Q99575 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POP1Q99575 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
POP1Q99575 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POP1Q99575 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POP1Q99575 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POP1Q99575 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POP1Q99575 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POP1Q99575 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POP1Q99575 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POP1Q99575 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POP1Q99575 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POP1Q99575 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POP1Q99575 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms