Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PIK3R4Q99570 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PIK3R4Q99570 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PIK3R4Q99570 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
PIK3R4Q99570 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156 ms