Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTAGE1Q96RT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTAGE1Q96RT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTAGE1Q96RT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms