Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP3Q96P47 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP3Q96P47 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms