Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC115Q96NT0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC115Q96NT0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms