Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC17Q96LX7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC17Q96LX7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC17Q96LX7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms