Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00615Q96LM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC00615Q96LM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms