Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EP400Q96L91 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
EP400Q96L91 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
EP400Q96L91 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms