Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf36Q96KX1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf36Q96KX1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf36Q96KX1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf36Q96KX1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf36Q96KX1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf36Q96KX1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf36Q96KX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf36Q96KX1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf36Q96KX1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4orf36Q96KX1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf36Q96KX1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf36Q96KX1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms