Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNDP1Q96KN2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNDP1Q96KN2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms