Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52L3Q96J77 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TPD52L3Q96J77 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms