Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM3Q96HU1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSM3Q96HU1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms