Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNF8Q96H20 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNF8Q96H20 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNF8Q96H20 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms