Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC41A3Q96GZ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC41A3Q96GZ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms