Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGTBQ96EQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGTBQ96EQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTBQ96EQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms