Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1AQ96CP6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1AQ96CP6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1AQ96CP6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms