Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC127Q96BQ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC127Q96BQ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC127Q96BQ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC127Q96BQ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC127Q96BQ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC127Q96BQ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC127Q96BQ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC127Q96BQ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC127Q96BQ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC127Q96BQ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC127Q96BQ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms