Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP7Q93009 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP7Q93009 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP7Q93009 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP7Q93009 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP7Q93009 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP7Q93009 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP7Q93009 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP7Q93009 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP7Q93009 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP7Q93009 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP7Q93009 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP7Q93009 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP7Q93009 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP7Q93009 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP7Q93009 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP7Q93009 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP7Q93009 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP7Q93009 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP7Q93009 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP7Q93009 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP7Q93009 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP7Q93009 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP7Q93009 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP7Q93009 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP7Q93009 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP7Q93009 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP7Q93009 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP7Q93009 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP7Q93009 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP7Q93009 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP7Q93009 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP7Q93009 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP7Q93009 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP7Q93009 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP7Q93009 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP7Q93009 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP7Q93009 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP7Q93009 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP7Q93009 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP7Q93009 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP7Q93009 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP7Q93009 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP7Q93009 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP7Q93009 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP7Q93009 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP7Q93009 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP7Q93009 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP7Q93009 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP7Q93009 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP7Q93009 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP7Q93009 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP7Q93009 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP7Q93009 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP7Q93009 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP7Q93009 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP7Q93009 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP7Q93009 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP7Q93009 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP7Q93009 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP7Q93009 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP7Q93009 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP7Q93009 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP7Q93009 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP7Q93009 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP7Q93009 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP7Q93009 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP7Q93009 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP7Q93009 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP7Q93009 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP7Q93009 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP7Q93009 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP7Q93009 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP7Q93009 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP7Q93009 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP7Q93009 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP7Q93009 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP7Q93009 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP7Q93009 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP7Q93009 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP7Q93009 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP7Q93009 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP7Q93009 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP7Q93009 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP7Q93009 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP7Q93009 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP7Q93009 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP7Q93009 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP7Q93009 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP7Q93009 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP7Q93009 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP7Q93009 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP7Q93009 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP7Q93009 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP7Q93009 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP7Q93009 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP7Q93009 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP7Q93009 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP7Q93009 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP7Q93009 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms