Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRN2Q92932 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRN2Q92932 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRN2Q92932 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRN2Q92932 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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