Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A6Q92581 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A6Q92581 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms