Protein–RNA interactions for Protein: Q92552

MRPS27, 28S ribosomal protein S27, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS27Q92552 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MRPS27Q92552 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MRPS27Q92552 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPS27Q92552 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms