Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGP1Q92546 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGP1Q92546 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RGP1Q92546 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGP1Q92546 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGP1Q92546 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGP1Q92546 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGP1Q92546 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGP1Q92546 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGP1Q92546 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RGP1Q92546 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGP1Q92546 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGP1Q92546 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGP1Q92546 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RGP1Q92546 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGP1Q92546 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RGP1Q92546 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RGP1Q92546 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGP1Q92546 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGP1Q92546 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGP1Q92546 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGP1Q92546 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGP1Q92546 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGP1Q92546 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGP1Q92546 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGP1Q92546 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGP1Q92546 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGP1Q92546 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGP1Q92546 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGP1Q92546 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGP1Q92546 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGP1Q92546 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGP1Q92546 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGP1Q92546 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGP1Q92546 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RGP1Q92546 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGP1Q92546 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms