Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC107Q8WV48 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms