Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA1Q8NG27 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PJA1Q8NG27 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA1Q8NG27 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms