Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIPA2Q8N8Q9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NIPA2Q8N8Q9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIPA2Q8N8Q9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPA2Q8N8Q9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms