Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP4Q8N3C7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP4Q8N3C7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP4Q8N3C7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP4Q8N3C7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms