Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4XQ8N0W4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4XQ8N0W4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms