Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2Q8IXS6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM2Q8IXS6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM2Q8IXS6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms