Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMPRSS6Q8IU80 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS6Q8IU80 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms