Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNKQ7Z7G1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLNKQ7Z7G1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms