Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZD4Q76G19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDZD4Q76G19 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms