Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMUB2Q71RG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms