Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP43Q70EL4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP43Q70EL4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP43Q70EL4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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