Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEND4Q6ZU67 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEND4Q6ZU67 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEND4Q6ZU67 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEND4Q6ZU67 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BEND4Q6ZU67 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEND4Q6ZU67 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEND4Q6ZU67 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEND4Q6ZU67 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEND4Q6ZU67 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BEND4Q6ZU67 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms