Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY4Q6ZNE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY4Q6ZNE9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 350.5 ms